Méningites
Un homme de 50 ans, opéré d’une tumeur au cerveau, présente 2 jours après l’opération une forte fièvre.
Une hémoculture et une analyse cytobactériologique du LCR sont demandées.
Aspect du prélèvement | Trouble |
Leucocytes par mm3 | 1000 |
Formule leucocytaire du LCR | Granulocytes neutrophiles 90% Lymphocytes 10 % |
Glycorachie | 0,25 g/L |
Protéinorachie | 3,4 g/L |
Gram après cytocentrifugation | Observation de bacilles à Gram négatif |
Glycémie | 1,05 g/L |
Procalcitonine sérique | non dosée |
Questions
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L’aspect trouble du LCR indique que le sujet présente une méningite purulente très probablement bactérienne. En fait, ce sont les leucocytes présents dans le prélèvement qui font que le liquide est trouble. C’est pourquoi, il n’était pas nécessaire dans ce cas de déterminer la concentration en leucocytes.
La protéinorachie est au dessus des valeurs normales (0,15 à 0,45 g/l) et la glycorachie représente 0,25/1.05 = 0,24 soit 24% de la glycémie, ce qui est bien en dessous de la valeur normale (66% de la glycémie).
Avec le résultat de la coloration de Gram, on peut dire que le sujet présente une méningite dans laquelle un bacille à Gram négatif est impliqué.
Liens utiles |
Diagnotic des méningites au laboratoire |
Gélose chocolat enrichie incubée sous atmosphère enrichie en CO2 | Présence d’un seul type de colonie de 3 mm de diamètre, blanchâtre, à bords réguliers et surface lisse |
Gélose au sang incubée sous atmosphère enrichie en CO2 | Présence d’un seul type de colonie, non hémolytique, de 3 mm de diamètre, blanchâtre, à bords réguliers et surface lisse |
Gélose Schaedler + vit K3 + sang de mouton incubée en anaérobiose | Présence d’un seul type de colonie, non hémolytique, de 3 mm de diamètre, blanchâtre, à bords réguliers et surface lisse |
Flacon d’hémoculture aérobie ensemencé avec le LCR | Croissance détectée dans le flacon. Observation de bacilles à Gram négatif |
Antibiogramme sur milieu MH |
AMX = amoxicilline – AMC = amoxicilline + acide clavulanique (augmentin) |
Flacon d’hémoculture aérobie | Absence de culture |
Flacon d’hémoculture anaérobie | Absence de culture |
Nous sommes dans un contexte d’infection nosocomiale. Dans ce cas, il faut aussi rechercher des bactéries anaérobies strictes.
La liste des germes susceptibles d’être responsable de la méningite est longue et beaucoup d’entre eux sont connus pour leur multirésistance. L’antibiothérapie probabiliste pourrait échouer. Pour trouver rapidement un antibiotique efficace, il est recommandé d’ensemencer un antibiogramme directement avec le LCR. Recommandation capitale dans ce contexte d’infection nosocomial car les germes hospitaliers présentent souvent des résistances aquises aux antibiotiques.
Si la méningite avait été polymicrobienne, la lecture n’aurait pas été possible. Or dans le cas présent, il n’existe qu’un seul type de colonie sur les isolements, la méningite est donc monomicrobienne.
Enfin si la densité de la culture avait été trop faible, l’interprétation aurait été délicate.
Examens microscopiques des colonies obtenues et des bouillons d’hémoculture.
Réaliser un test enzymatique d’orientation sur les colonies.
Avec le flacon d’hémoculture aérobie, ensemencer une gélose chocolat enrichie incubée sous atmosphère enrichie en CO2 et une gélose au sang incubée en aérobiose
Avec le flacon d’hémoculture anaérobie, ensemencer deux géloses au sang, une incubée en aérobiose, l’autre en anaérobiose.
Interpréter les résultats de l’antibiogramme.
Gram | Bacilles à Gram négatif |
État frais |
Bacilles mobiles probablement par ciliature péritriche |
Test Oxydase |
Oxydase – |
Effectivement, avant d’indiquer que la bactérie isolée est sensible à un antibiotique, il faut s’assurer qu’elle n’appartient pas à une espèce naturellement résistante à cet antibiotique. La liste des antibiotiques efficaces sur la bactérie isolée reste donc incertaine avant son identification.
En revanche, cet antibiogramme est utile car il permet de disposer à ce stade de l’analyse d’une liste d’antibiotique inefficaces.
Trois arguments permettent d’écarter l’éventualité d’une méningite à Haemophilus influenzae :
- Haemophilus influenzae est incapable de cultiver sur gélose au sang ou alors les colonies obtenues sont minuscules
- Haemophilus influenzae est immobile
- iHaemophilus influenzae est rarement responsable de méningite nosocomiale.
Le test oxydase négatif permet d’éliminer les Pseudomonas.
Le contexte d’infection nosocomiale oriente vers une méningite à entérobactérie. Le technicien décide de poursuivre l’identification en ensemençant une galerie API 20E accompagnée d’un contrôle de pureté.
Lecture du contrôle de pureté = nombreuses petites colonies incolores et quelques colonies jaunes plus grosses |
Flacon d’hémoculture aérobie | Absence de culture |
Flacon d’hémoculture anaérobie | Absence de culture |
Étant donné que les hémocultures sont négatives après 48h et qu’elles le seraient probablement s’il y avait une entérobactérie dans la sang, on peut penser que la bactérie présente dans le LCR ne provient pas du sang. Elle a peut être été introduite au cours de l’opération chirurgicale.
Document utile |
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La galerie API 20E présente un profil caractéristique de Enterobacter aerogenes.
Liens utiles |
Identifieur « api » d’UPBM le Lab (un grand merci à Antoine Gaudin et Jean-Noël Joffin !) |
Dans la classification des entérobactéries en fonction de leur profil de résistance naturel aux bêta-lactamines, Enterobacter aerogenes fait partie du groupe 3. Cette espèce résiste donc naturellement à l’amoxicilline, l’augmentin et la céfalotine. Ces résistances naturelles se sont bien exprimées ici.
La souche isolée apparait sensible aux autres antibiotiques. Étant donné qu’elle ne présente pas de résistance naturelle à ces antibiotiques, on peut conclure que la souche isolée est bien sensible à ces antibiotiques.
AMX = amoxicilline – AMC = amoxicilline + acide clavulanique (augmentin) |
Liens utiles |
CASFM-EUCAST 2019 |
FIN DE L’ÉTUDE DE CAS |