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Infection intestinale coproculture cas 2

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Coproculture

Contexte

Un enfant de 3 ans souffre de diarrhées et présente une fièvre modérée et des douleurs abdominales. Il n’a pas voyagé récemment.

Son médecin prescrit une coproculture standard.

Résultats le premier jour d'analyse des selles
Aspect des selles
Selles pâteuses malodorantes avec des traces de sang
Gram objectif
X100
Flore comprenant 90% de petits bacilles à Gram négatif et 10% de bactéries à Gram positif
EF objectif
x40
Leucocytes : environ 12 /champ

Hématies : 6 /champs

Pas de mobilité en vol de moucheron, pas de levures

Résultats des cultures après 24 h d'incubation
BCP à 37°CNombreuses petites colonies lactose -. Quelques colonies lactose +
Hektoen à 37°CPrésence de deux types de colonies.  De nombreuses petites colonies de 0,5 mm de diamètre et quelques colonies de 2 à 3 mm de diamètre. Ces deux types sont de couleur saumon.
Yersinia CIN à 30°CPrésence de petites colonies rouges et de grosses colonies rouges.

Yersinia CIN yersinia enterocolitica

CAMPYLOSEL à 37°C sous atmosphère microaérobiePas de culture
Bouillon Mueller KauffmanPrésence d’un trouble

Questions

Pour faire apparaitre la réponse, cliquez sur la question !

 

1.Interpréter les résultats des examens microscopiques des selles.

La flore est déséquilibrée.

La présence de leucocytes oriente vers une diarrhée inflammatoire.

Suspicion d’une infection invasive par le bacille à Gram négatif dominant.

Il ne semble pas qu’il y ait des Campylobacter ou des Vibrio car il n’a pas été observé de bactérie présentant une mobilité « en vol de moucheron ». Mais cela reste à confirmer en poursuivant la recherche des Campylobacter par la culture. En revanche, l’ensemencement de milieux sélectifs des Vibrio n’a pas été jugé nécessaire car il n’y a pas de notion de voyage récent.

Liens utiles
Coproculture

 

 

2. Interpréter les résultats des cultures obtenues le deuxième jour de l’analyse.

Le bacille Gram négatif dominant semble former les petites colonies lactose – sur BCP.

Les colonies saumon sur Hektoen utilisent au moins un des 3 glucides, ce ne sont pas des Salmonella, ni des Shigella.

Les deux types de colonies sur Yersinia CIN sont rouges donc mannitol +. Ces colonies sont suspectes d’être des Yersinia.

 

3. Indiquer le travail que doit effectuer le technicien le deuxième jour de l’analyse.

Isolement sur milieu chromogène sélectif des Salmonella, la culture en bouillon Rappaport-Vassiliadis.

Éventuellement un tests uréase rapide avec les deux types de colonies rouges sur Yersinia CIN.

Poursuite de l’identification des 2 types de colonies rouges (avec API 20E par exemple)

Remise à l’étuve du milieu Campylosel.

Résultats obtenus par le technicien le deuxième jour de l’analyse
Les tests uréase réalisés sur les deux types de colonies sont négatifs.
Résultats obtenus par le technicien le troisième jour de l’analyse
Pas de culture sur Campylosel et présence seulement de colonies bleues sur le milieu Rambach.

 

4. Expliquer pourquoi le technicien a poursuivi l’identification alors que les tests uréase étaient négatifs.

Effectivement les Yersinia enterocolitica et pseudotuberculosis sont uréase +. Cependant il ne serait pas prudent d’écarter les Yersinia avec un test négatif, d’autant plus quand il s’agit d’un test rapide. L’intérêt de ce test est relatif puisque l’analyse est poursuivie quel que soit son résultat.

 

Résultats de la galerie API20E ensemencée avec les petites colonies sur Yersinia CIN

Lecture du contrôle de pureté = un seul type de colonie

API 20E Yersinia enterocolitica

5. Lire la galerie API 20 E et établir le code.

. . On observe un seule type de colonie sur le contrôle de pureté, la suspension utilisée pour ensemencer la galerie n’a pas été contaminée.

Profil API 20E Yersinia enterocolitica

Document utile
Fiche lecture galerie API20E
Fiche technique de la galerie API 20E

 

6. Saisir le code sur l’identifieur "api" et identifier les petites colonies rouges sur Yersinia CIN.

La galerie API 20E présente un profil caractéristique de Yersinia enterocolitica.

Liens utiles
Identifieur « api » d’UPBM le Lab (un grand merci à Antoine Gaudin et Jean-Noël Joffin !)

 

Résultats de la galerie API20E ensemencée avec les grosses colonies sur Yersinia CIN

Lecture du contrôle de pureté = un seul type de colonie

Profil API 20E Enterobacter aerogenes

7. Lire la galerie API 20 E et établir le code.

On observe un seule type de colonie sur le contrôle de pureté, la suspension utilisée pour ensemencer la galerie n’a pas été contaminée.

Profil API 20E Enterobacter aerogenes

Document utile
Fiche lecture galerie API20E
Fiche technique de la galerie API 20E

 

8. Saisir le code sur l’identifieur "api" et identifier les grosses colonies rouges sur Yersinia CIN.

La galerie API 20E présente un profil caractéristique de Enterobacter aerogenes.

Liens utiles
Identifieur « api » d’UPBM le Lab (un grand merci à Antoine Gaudin et Jean-Noël Joffin !)

 

9. Indiquer le travail que doit effectuer le technicien en Jour 3. Justifier la démarche.

Ensemencer les milieux suivants avec la souche de Yersinia enterocolitica :
gélose à l’esculine
un Hugh et Leifson + Xylose à 1%
un Hugh et Leifson + Tréhalose à 1%.
Cette galerie permettra de connaitre le biotype de la souche.

Résultats de la galerie pour le biotypage
La souche apparaît esculine – ; xylose – et tréhalose +

 

10. Identifier le biotype de cette souche de <em>Yersinia enterocolitica </em>et proposer une conclusion à cette analyse.

La souche est une Yersinia enterocolitica de biotype 4. C’est un biotype pathogène.

Diarrhée due à Yersinia enterocolitica biotype 4

Liens utiles
Identification des biotypes de Yersinia enterocolitica

 

11. Proposer une conclusion à cette analyse.

Ce patient présente une diarrhée causée par une souche de Salmonella Enteritidis.

La souche est envoyée à l’Institut Pasteur pour vérifier le sérotype et le médecin doit déclarer ce cas de TIAC aux autorités sanitaires.

 

12. Interpréter les résultats obtenus sur Rambach et Campylosel le troisième jour de l’analyse.

Les colonies bleues sur Rambach sont Propylène glycol – et ß galactosidase +, ce ne sont pas des Salmonella : absence de Salmonella dans les selles

Pas de culture sur Campylosel = absence de Campylobacter.

 

13. Indiquer si les petites colonies de couleur saumon sur Hektoen et les petites colonies lactose – sur BCP peuvent être des colonies de <em>Yersinia enterocolitica</em>. Justifier la réponse.

Les petites colonies lactose – sur BCP et les petites colonies glucides + sur Hektoen sont probablement les Yersinia (Yersinia enterocolitica est lactose – et saccharose +.

 

FIN DE L’ÉTUDE DE CAS

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