Explications :

Les colonies sont oranges si le germe utilise un des 3 glucides présents dans le milieu. Ce peut être le lactose, le saccharose ou la salicine. Elles ne sont pas obligatoirement lactose +.
Comme, il est vrai que de très rares souches de Salmonella sont lactose +, vous n'avez pas eu de pénalités si vous avez coché qu'elles étaient susceptibles d'être des Salmonella.

Explications :

La gélose SS est incubée à 37°C et la gélose sélective de Clostridium difficile est incubée en anaérobiose.

Explications :

Il s'agit de comparer le % de Gram + au % de Gram -. On parle de flore déséquilibrée lorsqu'un de ces pourcentages dépasse 90 %

Explications :

Les Shigella sont toutes H₂S-.

Explications :

Un bouillon d'enrichissement est un milieu de culture liquide qui contient des inhibiteurs de certaines bactéries de façon à favoriser la culture de la bactérie qu'on souhaite enrichir. "Enrichir" signifie que parmi les bactéries présentes après incubation, le % de la bactérie souhaitée a été augmenté. Le bouillon Rappaport permet d'augmenter la fraction (%) de Salmonella.
Ce n'est bien sûr pas un milieu de transport car par définition un milieu de transport doit maintenir la viabilité des bactéries présentes tout en empêchant leur développement. Un milieu de culture ne peut donc pas servir de milieu de transport.

Explications :

Les peptones du milieux apportent la source de carbone et d'énergie nécessaire à la culture des Shigella. Les Shigella sont donc capables d'y cultiver alors qu'elles n'utilisent aucun des glucides présents. Toute bactérie utilisant un des glucides formera des colonies oranges alors que les Shigella forment des colonies vertes. Avoir placé 3 glucides dans ce milieu augmente donc son caractère discriminant.

Explications :

Pour affirmer qu'il n'y a pas de Salmonella dans les selles, il faut vérifier l'absence de colonies suspectes (vertes avec ou sans centre noir sur Hektoen) après la phase d'enrichissement (par exemple en bouillon Rappaport).

Explications :

Pour conclure à une infection à Clostridium difficile, il faut mettre en évidence dans les selles d'un sujet symptomatique une des toxines sécrétées par certaines souches de Clostridium difficile. La mise en évidence du gène d'une des toxines est aussi une solution pour repérer ces souches toxinogènes mais cette méthode plus sensible donne des résultats positifs alors que la production de toxine est faible voire nulle. Dans le cas où seul le gène d'une toxine est mise en évidence mais pas de toxine, c'est le médecin qui décidera en fonction du tableau clinique si le sujet présente une ICD ou pas. L'item "si le gène d’une des toxines de Clostridium difficile est mis en évidence" pouvait être coché ou pas.

La mise en évidence de la glutamate déshydrogénase indique qu'il y a bien une souche de Clostridium difficile dans les selles mais ne suffit pas pour conclure à une infection à Clostridium difficile.

Explications :

Bien sûr, en théorie, il doit être possible de mettre en évidence des virus dans les selles par microscopie électronique ou en ensemençant des tapis de culture cellulaire. Mais ces deux méthodes ne sont pas adaptées pour un travail de routine.